Помпоний Амальтео родился, согласно «ЭСБЕ», в городе Сан-Вито-аль-Тальяменто (по другим данным в Мотта-ди-Ливенца) в 1505 году.
Живописи Амальтео учился у Джованни Антонио Порденона (итал. ; 1484–1539)), на дочери которого он был женат и которому он старательно подражал по внешней манере письма, особенно в виртуозном исполнении фресок.
В 1333 году, в Сан-Вито-аль-Тальяменто, Амальтео написал фигуры святых в соборе, на которых, по мнению некоторых, отразилось влияние стиля Тициана, у которого, по предположению некоторых историков, Амальтео выступал в роли модели Позднее Помпоний Амальтео в ратуше Ценеды, где написал «Историю Сузанны», «Суд Соломона» и другие работы.
С 1536 года он вновь работал в городе Сан-Вито-аль-Тальяменто, который уже не покидал до самой смерти. В христианской церкви Санта-Марии-де-Баттути, где он разукрасил хоры и купол многочисленными изображениями библейских сцен и отдельными группами фигур. Другие работы его находятся также в Продолоне, Удине, Казарзе и Вальвазоне. Один из основоположников современного искусствознания Джорджо Вазари весьма высоко оценивал его работы.
Помпоний Амальтео скончался 9 марта 1588 года (по данным «ЭСБЕ» - 1584) в Сан-Вито-аль-Тальяменто.
Брат Помпония Джироламо (англ. ) занимался миниатюрной живописью, а дочь Квинтилия живописью и скульптурой.