Из дворян Калужской губернии. Зачислен в л.-гв. Преображенский полк сержантом 25 мая 1775. Произведён в прапорщики 1 января 1792.
Сражался со шведами в 1788-1799 гг. В полковники произведён 10 декабря 1798 и 7 апреля 1801 назначен шефом Смоленского мушкетерского полка. В генерал-майоры пожалован 16 апреля 1800, но уже 10 ноября был уволен в отставку. 17 марта 1801 обратно принят на службу. Воевал с французами в 1805 г., был ранен пулей в правую ногу под Аустерлицем. В 1806-1811 гг. воевал с турками, будучи в Дунайской армии. 11 августа 1810 назначен командиром 1-й бригады 12-й пехотной дивизии. 15 февраля 1811 ему повелено быть командующим 12-й пехотной дивизии.
В начале 1812 г. 12-я пехотная дивизия, которой командовал Колюбакин, входила в 7-й пехотный корпус 2-й Западной армии. Был ранен в руку картечью под Салтановкой. В 1813 г. находился при осаде Данцига. 22 августа 1814 утверждён начальником 12-й пехотной дивизии, которой командовал до 1 октября того же года. Уволен в отставку 1 декабря 1814 за ранами с мундиром. 12 июля 1818 ему была назначена пенсия полного жалования по его прежнему чину.