Принадлежал к обедневшей ветви древнего патрицианского рода Квинтилиев. Его дед по отцовской линии, Секст Квинтилий Вар, был сенатором. Его отец, Секст Квинтилий Вар, также сенатор, сочувствовал республиканцам в гражданской войне с Юлием Цезарем. Неизвестно, участвовал ли он в убийстве Цезаря, но впоследствии он поддерживал Брута и Кассия и покончил с собой после поражения при Филиппах 43 году до н. э.. Матерью Публия Квинтилия Вара была дочь Гая Клавдия Марцелла Младшего от первого брака.
Несмотря на политику отца, Вар стал поддерживать преемника Цезаря — Октавиана, позже ставшего именоваться Цезарем Августом. Вар женился на Випсании Марцелле (дочери соратника Октавиана Марка Випсания Агриппы) и стал близким другом и Августа, и Агриппы. Таким образом, его политическая карьера была стремительна: уже в 13 году до н. э. он был избран консулом вместе с Тиберием, пасынком Августа.
Вслед за консулатом Вар в 7—6 годах до н. э. отправился на год в провинцию Африка в ранге проконсула. В 6—4 годах до н. э. он получил должность пропреторского легата Сирии, где под его командованием оказались четыре легиона. Иосиф Флавий упоминает молниеносные действия Вара против мессианского восстания в Иудее после смерти в 4 году н. э. царя Ирода Великого. После захвата Иерусалима он распял около 2000 еврейских повстанцев.
После наместничества в Иудее Вар несколько лет провёл в Риме. В это время умерла Випсания Марцелла, и он женился вторично на Клавдии Пульхре, дочери Клавдии Марцеллы Младшей (дочери консула Гая Клавдия Марцелла Младшего и Октавии, сестры императора) и Гая Клавдия Пульхра, патриция по рождению, усыновлённого, уже после рождения дочери, в патрицианский род Валериев Мессал Марком Валерием Мессалой в конце 14 года до н. э. У них родился сын Публий Квинтилий Вар Младший. Это брак показал, что Вар находится в фаворе у Августа.
В первые годы первого столетия Тиберий и его брат Друз совершили несколько походов в Германию — область восточнее Рейна и севернее Дуная — в попытке раздвиинуть границы империи и уменьшить их протяжённость. Они подчинили власти Рима несколько германских племён, таких как херуски. В 7 году этот регион был объявлен подчинённым Риму, и Вар был назначен первым пропретором провинции Германия. В это же время Тиберий с легионами был переброшен на Балканы в связи со вспыхнувшим в Паннонии и Далмации восстанием.
Будучи пропретором Германии, Вар продолжил ту же жёсткую политику устрашения и подавления, которую использовал в Иудее и Африке. Произвол наместника и полное попрание всех устоявшихся законов и традиций подстегнули недавно покорённые германские племена к восстанию, которое возглавил вождь херусков Арминий. К этому времени Арминий уже успел отличиться на службе Риму: командовал конной алой, состоявшей из германцев и за храбрость был удостоен римского гражданства и всаднического достоинства.
В конце лета 9 года Вар с тремя легионами (XVII, XVIII и XIX) стоял на берегу Везера, когда ему пришла весть, что в отдалённом зарейнском племени марсов вспыхнуло восстание.
Доверившись совету Арминия, Вар повёл легионы на подавление восстания короткой дорогой через Тевтобургский лес, стремясь подавить восстание и вернуться в зимние лагеря до наступления холодов. Проходя через лес, римское войско стало подвергаться частым нападениям германцев, которые, пользуясь местностью, внезапно нападали и быстро отступали, не дожидаясь ответного удара. Заболоченная местность не давала возможности маневрировать пехоте, а ограниченность свободного пространства сделала кавалерию практически бесполезной. К тому же, начавшиеся дожди размыли дорогу, и в образовавшемся болоте совершенно увяз обоз. Вар понял, что попал в западню и попытался отступить к Рейну. Сопровождавшие легионы вспомогательные войска, состоявшие из германцев, открыто перешли на сторону восставших. После этого битва продолжалась три дня и закончилось полным поражением римских войск. Вар был ранен, и, дабы не попасть в плен, покончил с собой, бросившись на меч. За ним последовали высшие офицеры. Часть кавалерии, бросив пехоту, попыталась пробиться к Рейну, но была перехвачена германцами и уничтожена.
В общем итоге потери римлян составили 25—27 тысяч человек. Примерно 5 тысячам удалось спастись. Часть попавших в плен легионеров были посажены в клетки из прутьев и сожжены заживо. Остальные были или проданы в рабство, или, впоследствии, выкуплены. Тацит сообщает, что захваченные в плен командиры были принесены в жертву германским богам. Арминий отослал голову Вара вождю маркоманов Марободу, с которым стремился заключить союз, но Маробод отклонил предложение и отослал голову в Рим.
Результатом этого поражения стало полное освобождение зарейнских областей от римского владычества. Позднейшие попытки покорить германцев между Рейном и Эльбой не имели успеха.
О реакции Октавиана на это событие Светоний сообщает следующее:
Тихо мурлычет
Луны самовар,
Ночь дымоходами стонет:
— Вар, а Вар?
— Вар, отдай легионы!
— Нас приласкают вороны,
Выпьют глаза из голов! -
Молча поют легионы
Тихие песни без слов.
[…]
— «Песня легионеров», Роальд Мандельштам