В молодости учился в Коста-Рике и Бельгии, где встретил Ивонн Клейс Сполдерс (Yvonne Clays Spoelders, 1906—1994), на которой женился 28 июля 1927 года. Супруга Кальдерона активно помогала в государственных делах, в 1940 году была переводчиком на встрече Кальдерона и президента США Франклина Рузвельта, а впоследствии стала дипломатом.
Их сын Кальдерон Фурнье, Рафаэль Анхель был президентом Коста-Рики в 1990—1994 годах.