После смерти в 1232 году Рудольфа II родовые владения Габсбургов были разделены между его детьми: Альбрехтом IV и Рудольфом III. Альбрехту досталась западная часть Швейцарии, а Рудольфу земли в восточной части, включая впоследствии восточную часть Ааргау, Тургау, Клеттгау, Кибург и ряд ленов в Бургундии. Поэтому с 1232 года Рудольф III становится так же графом Клеттгау и ландграфом Зундгау.
В 1220 году Рудольф III женился на Гертруде Регенсбург (нем. Gertrud von Regensburg, 1200—1264).