Балтиев начал карьеру в клубе «Кайнар», в возрасте 18 лет. В 1997 году перешел в «Кайрат», а позже в другой алматинский клуб «ЦСКА-Кайрат». Затем Балтиев отправился в «Аксесс-Голден Грейн», далее переходит в «Сокол» из Саратова. В чемпионате России выступал за клубы «Динамо М», «Москва», «Шинник», и «Жемчужина-Сочи».
В 2007 году Руслан Балтиев подписывает контракт с «Тоболом». Балтиев становится победителем Кубка Интертото. За 3 сезона Руслан был одним из лучших в составе «Тобола».
С сезона 2010 — игрок клуба «Жемчужина-Сочи».
13 января 2011 года по обоюдному согласию расторг контракт с «Жемчужиной». Балтиев вернулся на родину и перешел в «Кайрат».
2 сентября 1997 года дебютировал за национальную сборную Казахстана против сборной Китая. 20 сентября 1997 года отличился голом в со сборной Узбекистана. 10 декабря 2000 года забил два мяча в ворота ОАЭ. Балтиев является рекордсменом сборной по количеству сыгранных игр (сыграл 73 матча и забил 13 голов).
В январе 2010 года Руслан Балтиев заявил о завершении выступлений за сборную Казахстана, 31-летний игрок извинился перед болельщиками и назвал главной причиной своего ухода усталость.