В 1915 году окончил русско-киргизское училище. В 1921-1935 годах работал председателем Дегеленского волисполкома, членом Каркаралинского уездного исполкома, народным судьёй, ответственным работником управления Туркестано-Сибирской железной дороги, Наркомзема КазАССР. В 1935-1960 годах работал в газете «Темiржолшы», Институте языкознания и литературы. С 1940 года являлся членом КПСС.
Награждён орденом Дружбы народов, двумя орденами «Знак Почёта» и медалями СССР.
Литературную деятельность начал как поэт. Первое стихотворение «?аза? бозбаларына» («Казахским юношам») было опубликовано в журнале «Ай?ап» в 1914 году. В лирико-романтических поэмах и стихотворениях «Месть сокола» (1943), «Цимлянское море» (1953), «Таинственный источник» (1963) и других Бегалин воспевал преобразования в стране, красоту родного края. Поэма «Крылатый казах» (1947) посвящена Герою Советского Союза Нуркену Абдирову. Многие рассказы и повести, адресованные детям, — «Яблоко Ермека» (1955, 1985), «Сатжан» (1947, 1973, 1978), «Молодая ветка» (1953), «Подросток» (1960), «Школьные друзья» (1961), «Перевалы Чокана» (1971) и другие пронизаны любовью к Родине, идеями советского патриотизма и интернационализма.
Сапаргали Бегалин также занимался собиранием и исследованием образцов казахского устного творчества, внёс значительный вклад в публикацию и издание произведений известных народных поэтов Исы Байзакова, Доскея Алимбаева, Шашубая Кошкарбаева, Куата Терибаева, Толеу Кобдикова, написал монографию о жизни и творчестве Джамбула Джабаева (1946).
На стихи Бегалина создано около 50 песен («Пионерская песня», «Каракоз», «Весна», «Колыбельная», «Белый голубь», «Тоскую по тебе, любимая» и другие).
Сапаргали Бегалиным на казахский язык были переведены некоторые стихотворения А. С. Пушкина, М. Ю. Лермонтова, Т. Г. Шевченко, рассказы и повести Д. Н. Мамина-Сибиряка, Л. В. Соловьёва.
В честь Сапаргали Бегалина названа Государственная республиканская детская библиотека в Алматы.