Внёс большой вклад в теорию египетского языка. Созданная им «Египетская грамматика: введение в изучение иероглифов» до сих пор остаётся стандартной справочной грамматикой. Опираясь на достижения представителей берлинской египтологической школы: Адольфа Эрмана и Курта Зете — Гардинер систематизировал знания о египетском языке и выпустил в 1927 «Египетскую грамматику», сочетавшую исчерпывающий грамматический материал с доступными объяснениями и учебными заданиями.
Гардинер принимал активное участие в создании фундаментального «Берлинского словаря египетского языка». Считая одной из главных задач египетской филологии толкование египетских текстов, он издал и откомментировал множество ценных памятников. Его исследование египетских «ономастиконов» (см. Рамессеумский ономастикон) позволило определить значение множества египетских слов, а также внесло большой вклад в изучение исторической географии Древнего Египта.
Помимо специально египтологических трудов, Гардинер — автор оригинальных работ по общему языкознанию.