Сергей Лобовиков родился 19 июня 1870 года, в Вятской губернии, в семье сельского дьякона. Получил четырехлетнее образование в сельской школе, затем в духовном училище. Рано осиротев, в 14 лет был отдан на обучение купцу и фотографу П. Г. Тихонову в губернский город Вятку. У него Лобовиков работал 5 лет по контракту без оплаты за труд. В 1892—1893 гг. проходил военную службу, от которой позже был освобожден по состоянию здоровья. Работал в Петербурге, однако затем вернулся в Вятку.
В 1894 г. Лобовиков, взяв в аренду небольшое помещение и фототехнику, открывает в Вятке собственное фотоателье. С 1899 года работает как фотохудожник, в этом же году он впервые участвует в фотографическом конкурсе в Петербурге, где сразу же получает бронзовую награду.
В 1900 году Лобовиков предпринимает путешествие по Западной Европе и посещает Германию, Бельгию, Францию, Австрию. В этом же году Лобовиков принимает участие во Всемирной выставке в Париже по теме «Крестьянский быт и труд крестьянина в России». На Всемирной выставке фотограф также получает бронзовую медаль.
В последующие годы Лобовиков участвует еще в нескольких международных выставках и конкурсах художественной фотографии, где получает новые награды:
С 1908 года Сергей Лобовиков является Председателем Вятского фотографического общества и одним из устроителей Художественного музея Вятки. Является одним из авторитетных мастеров фотографии 1920-х годов. С 1920 по 1934 год он преподаёт курс фотографии в Вятском педагогическом институте, а также работает в Вятском Государственном музее искусства и старины научным сотрудником и заведующим негативным фондом и фотокабинетом.
В 1927 году Русское фотографическое общество организовывает персональную выставку С. А. Лобовикова. В 1929 году фотохудожник участвует в международных выставках художественной фотографии в Нью-Йорке, Токио и Осаке.
В конце 1934 года Лобовиков с семьей переезжает в Ленинград, где до 1936 года работает в фотокинолаборатории Академии наук СССР.
Осенью 1941 года Сергей Лобовиков погибает во время бомбежки в городе Ленинграде.
Улица Спасская в Вятке
г. Вятка. Вид на город из-за реки (1910-е годы)
г. Вятка. Речной порт (1900-е годы)
Кафедральная площадь и Свято-Троицкий кафедральный собор (1890-е годы)
Александро-Невский собор
Воскресенский собор
Вид на улицу Вознесенскую
Обзорный вид Вятки