Отец — подполковник в отставке. Мать — воспитательница в детском саду. Старший брат, на шесть лет старше — военный в звании майора.
Сергей Бабкин окончил Харьковский лицей искусств и музыкальную школу по классу флейты. В 2000 году закончил Театральное отделение Харьковского Государственного Университета Искусств, в 1994 году в лицее познакомился с Андреем Запорожцем.
В 1999—2002 гг. являлся актёром Харьковского русского драматического театра имени А. С. Пушкина.
C 2000 года актёр только основанного тогда «Театра 19». На счету Бабкина такие роли как Х («Эмигранты»), Бес («Чмо»), Капитан («Двери»), Гамлет («Наш Гамлет»).
В этом же 2000 году он стал основателем и участником группы «5'nizza». На концертах он часто выступал со своей программой, но в рамках группы «Пятница»
1 ноября 2004 года вышел его сольный альбом «УРА!». В 2005 году вышел второй сольный альбом «БИС!», материалом которого являются песни, не вошедшие в альбом «УРА!». 14 ноября выходит третий альбом «Сын», посвященный сыну Сергея. Песни записывались с 2004 по 2005 год.
В июне 2007 года группа «5'nizza» выступает последний раз, после чего становится известно о распаде группы.
Вышедший в 2008 году альбом «Взблатнулось» является сборником перепевок блатных песен.
В конце 2008 года Сергей создает проект под названием K.P.S.S (Константин Шепеленко, Петр Целуйко, Станислав Кононов, Сергей Бабкин). В 2010 году группа K.P.S.S записала на Питерской студии «Добролет» дебютный альбом «Свинец».
Также в 2010 году был выпущен альбом «Снаружи и внутри», который, по мнению самого артиста, связал актёрскую песню с классической музыкой. Добился этого Сергей за счет привлечения симфонического оркестра к записи альбома.
Начиная с 2011 Сергей Бабкин начинает тесно сотрудничать с лидером группы «Океан Ельзи» Святославом Вакарчуком.
Вакарчук приглашает Сергея принять участие в его новом проекте, совместно с такими музыкантами, как Дмитрий Шуров (рояль, электропианино, электроорганы, металофон), Макс Малышев (барабаны, перкуссия), Петр Чернявский (бас-гитара, гитары). Сам Сергей, помимо вокального участия, играет в проекте на флейте и гитарах.
Из этого совместного творчества рождается проект «Брюссель». Одноименный альбом записывается в августе 2011 в Брюсселе на студии ICP Recording Studios. В альбом вошли 12 композиций, которые звучат на украинском и английском языках.
Общественная презентация проекта состоялась 13 декабря и была транслирована онлайн на канале YouTube.
В апреле 2012 планируется тур в поддержку этого альбома.
В 2005 году Бабкин Сергей женится на Лилии Ротань.
1 сентября 2005 рождается сын Илья Сергеевич Бабкин.
В 2007 году Сергей и Лилия Бабкины разводятся.
В 2008 году 11 мая — происходит обряд (таинство) венчания Сергея Бабкина и Снежаны Вартанян. У Снежаны сын от первого брака Артур. Артур родился 4 ноября 2006 года.
27 марта 2009 Сергей и Снежана вступают в офиц.брак.
7 сентября 2010 У Сергея и Снежаны родилась дочь Веселина.