В молодости был школьным учителем, потом библиотекарем во Франкфурте-на-Майне. Сначала занимался исследованиями по церковной истории. Ученое имя составил себе «Историей императоров-иконоборцев» (1812); в 1817 году получил кафедру в Гейдельбергском университете, где работал до самой смерти, пользуясь исключительной популярностью среди слушателей. Среди его учеников был в частности Йозеф Ашбах — в будущем один из самых именитых историков XIX века.
Главные труды: «Всемирная история» (первое издание 1844—1856 гг.) и «История 18 и 19 столетий до падения Французской империи» (1-е издание в двух томах вышло в 1823 году потом несколько раз перерабатывалось и дополнялось). «История 18 и 19 столетий до падения Французской империи» издавалась в 1858—1860 годах в переводе Н. Г. Чернышевского, А. П. Пыпина, Е. А. Белова и других в «Исторической библиотеке» при журнале «Современник». Русский перевод девятнадцатитомной «Всемирной истории» Ф. К. Шлоссера выходил в 1861—1869 годах под редакцией Н. Г. Чернышевского, а после его ареста под редакцией В. А. Зайцева.
Шлоссер сыграл немалую роль в истории развития общественной мысли в России. В переводе обоих главных его трудов на русский язык принимал деятельное участие Чернышевский: