Шириншо Шотемур (в истории СССР известен как Шотемор) родился в семье крестьянина-бедняка. Образование получил в Университете трудящихся Востока в Москве (1929).
Окончил трудовую педагогическую школу, затем учился на педагогических курсах в Ташкенте. Трудовую деятельность Шириншо Шотемур начал 13-летним юношей в хозяйстве Памирского пограничного отряда. С 1914 по 1918 год работал в Ташкентском железнодорожном депо, рабочим на заводе Иванова. С 1919 года рабочий в Ташкенте. В 1921 вступил в РКП(б). В 1921—1924 председатель ревкома на Памире, инструктор ЦК КП(б) Таджикистана. В 1921 году Шириншо Шотемур принимал участие в хлеборазверстке в Худжандском уезде. В том же году он в составе военно-политической тройки был послан на Памир.
Шотемур до 1923 года работал председателем Революционного Комитета, а после отъезда председателя Т. М. Дьякова, с 1922 года одновременно председателем военно-политической тройки. В 1923—1924 годах Шотемур работал инструктором подотдела национальных меньшинств ЦК Компартии Таджикистана. Одновременно он руководил таджикской коммунистической секцией.
В 1925—1927 нарком Рабоче-крестьянской инспекции и уполномоченный ЦК КП(б) Узбекской ССР и Таджикской ССР. Возглавлял операции по уничтожению басмачей и их «пособников» в Таджикистане. С 1929 ответственный секретарь Таджикского обкома КП(б) Узбекистана.
Шириншо Шотемур является одним из основных организаторов создания Таджикской Автономной Советской Социалистической Республики и ради этой цели, он отдал много сил, энергии и даже жизнь. В 1924 году при оформлении в Ташкенте первого в истории Таджикского правительства Шириншо Шотемур был назначен Наркомом рабоче-крестьянской инспекции и уполномоченным Центральной Контрольной комиссии КП(б) Узбекистана в Таджикистане. Кроме основной работы на Шотемура по совместительству временно были возложены обязанности народного комиссара финансов, председателя комиссии взаимопомощи партийцам и руководство тройкой по проведению режима экономики в республике.
В 1927 году Шотемур работал постоянным представителем Таджикской АССР в Узбекской ССР. Тогда же он был направлен на учёбу в Московский университет трудящихся Востока (КУТВ). На второй Таджикской областной партийной конференции (3—10 февраля 1929 г.) Шотемур заочно был избран членом областного комитета партии, а первый пленум Обкома партии избрал его ответственным (первым) секретарем Таджикского обкома партии.
Большой вклад Шотемур внес в присоединении Худжандского округа к Таджикистану и образовании Таджикской ССР.
Он смело ставил вопрос перед Политбюро ЦК ВКП (б) о выделении Таджикской республики из состава Узбекской ССР в самостоятельную республику.
На первом Учредительном съезде КП (б) Таджикистана 6—15 июня 1930 г. Шотемур был избран вторым секретарем ЦК КП (б) Таджикистана. В 1932 г. по настойчивой просьбе Шириншо Шотемура он был откомандирован на учёбу в Институт красной профессуры в Москву, но в декабре 1933 г. он был отозван с учёбы и избран председателем Президиума ЦИК Таджикской ССР. На этом высоком посту он проработал до июня 1937 г. В 1930—1933 2-й секретарь ЦК КП(б) Таджикистана. С 1933 председатель ЦИК Таджикской ССР и один из председателей ЦИК СССР.
Шириншо Шотемур в период работы постоянно избирался в руководящие партийные и советские органы, в 1925—1934 годах был членом Совета национальностей ЦИК СССР.
В 1937 году по сфабрикованному обвинению в участии в антисоветской националистической организации был арестован в Москве. 21 октября Военной коллегией Верховного суда СССР приговорен к смертной казни, 27 октября 1937 г. расстрелян. Похоронен в Донском кладбище в Москве. Реабилитирован Военной коллегией Верховного суда СССР 11 августа 1956 г.
Награждён медалью ЦИК Таджикской ССР «За борьбу против басмачества» (1930), орденом «Трудового Красного Знамени» (1935), Указами президента Республики Таджикистан Э. Ш. Рахмонова посмертно награждён орденом «Дружба» (27.08.1999), званием «Герой Таджикистана» (9.09.2006).