Силвестре Варела — воспитанник академии клуба «Пашкадориш», откуда он в 2002 году перешёл в молодёжный состав лиссабонского «Спортинга». В 2004 году Варела перешёл, на правах аренды, в клуб «Каза Пия». В сезоне 2005/2006 Варела провёл первые 4 матча за клуб. В следующем году он вновь был отдан в аренду, в испанский клуб «Рекреативо», за который провёл 22 игры.
В июне 2008 года Варела вернулся в «Спортинг», но в то же межсезонье он был продан в клуб «Эштрела» (Амадора). За «Эштрелу» Варела провёл хороший сезон, забив 7 голов в 32 играх. Во время сезона, 3 марта 2009 года, Варела подписал 5-летний контракт с клубом «Порту». Футболист перешёл в «Порту» на правах свободного агента 1 июля.
В марте 2010 года Варела получил перелом малой берцовой кости, из-за чего выбыл из списка кандидатов на поездку на чемпионат мира 2010.
3 марта 2010 года Варела дебютировал в составе сборной Португалии, выйдя на замену в товарищеской игре с Китаем, в которой его сборная победила 2:0.