Ван дер Мер изобрёл метод стохастического охлаждения в коллайдерах, который позволил открыть W и Z бозоны на 500-гигаэлектронвольтном коллайдере в ЦЕРНе в эксперименте UA-1, проходившим под руководством Карло Руббиа.
Ван дер Мер является членом Королевской академии наук Нидерландов, а также Международной академии наук.