Пардо служил связистом в Армии обороны Израиля. Помимо прочего, исполнял должность начальника связи спецподразделения «Сайерет Маткаль», в ту пору под командованием Йони Нетаньяху. В этой должности, в качестве связиста командного звена, принял участие в операции «Энтеббе» по освобождению взятых в заложники пассажиров самолета компании «Air France» в аэропорту Энтеббе в Уганде.
В 1980 году, после окончания службы в армии, Пардо поступил на службу в «Моссад». Начиная с 1988 года, исполнял ряд командных должностей, связанных, в основном, с технологической сферой деятельности «Моссада». Помимо прочего, командовал Управлением электронной разведки «Моссада» — «Невиот».
После вступления Меира Дагана на пост директора «Моссада» в 2002 году Пардо стал заместителем Дагана. В данной должности Пардо, имевший на предыдущих постах в организации ограниченный опыт деятельности в сфере агентурной разведки, возглавил созданный Даганом оперативный штаб «Моссада», объединяющий оперативные управления «Моссада», ответственные за спецоперации, агентурную и технологическую деятельность.
В 2006 году временно перешёл в Армию обороны Израиля, сначала на должность инструктора в Колледже национальной безопасности армии, а затем на должность особого советника по спецоперациям в Генштабе армии. Сообщалось, что в последней должности тесно сотрудничал с Командующим Северным военным округом генерал-майором Гади Айзенкотом и, помимо прочего, координировал ряд неопубликованных спецопераций на территории Ливана. В 2007 году вновь занял пост заместителя директора «Моссада» .
В июне 2009 года Пардо вышел в отставку. Выход в отставку был вызван дополнительным продлением каденции Дагана, несмотря на ожидания Пардо сменить Дагана на посту директора «Моссада».
После выхода в отставку Пардо занялся частным бизнесом. Помимо прочего, сотрудничал с израильским бизнесменом Ноамом Ланиром (англ. ) в сфере продажи медицинских услуг израильских клиник по интернету; содержал также собственную консалтинговую компанию.
29 ноября 2010 года премьер-министр Израиля Биньямин Нетаньяху объявил о своём решении назначить Пардо на пост директора «Моссада» по истечении срока каденции Меира Дагана в январе 2011 года. Решение было утверждено правительством Израиля на заседании 5 ноября 2010 года. Пардо вступил на пост 6 января 2011 года.
Уже за первые полгода на посту Пардо произвёл обширные кадровые перестановки в организации, сменив, помимо прочего, главу Управления спецопераций «Кейсария», главу Управления электронной разведки «Невиот», главу Управления по внешним сношениям «Тевель», главу Разведывательного управления и главу Управления личного состава.
Пардо проживает в небольшом поселении в равнине Шарон в центре Израиля. Женат, отец двух детей (сын Йонатан и дочь). Обладает степенью бакалавра Тель-Авивского университета в области политологии и истории.