Окончила Географический факультет МГУ в 1974 году. В 1974—78 годы работала в Комплексной восточной экспедиции факультета (изучение Дальнего Востока), с 1978 года — в Институте географии Академии наук, где были защищены кандидатская (1974) и докторская (2004) диссертации. Доктор географических наук.
Работы Нефёдовой посвящены проблемам трансформации сельской местности России (сельского хозяйства, социальной сферы и т.п.) после перехода к рыночным отношениям. На основе анализа основных процессов в агропромышленном секторе, социальной сфере и структуре землепользования ею было проведено социально-экономическое районирование сельской местности России по степени «жизнеспособности» аграрного сектора и устойчивости сельских сообществ, на конкретных примерах (изученных в ходе экспедиционных исследований) показаны модели их адаптации к новым условиям.
Автор ряда научных публикаций, в том числе монографий: