У Хоглана появилась своя первая барабанная установка в 13 лет и он полный самоучка. В 1984-ом он начал свою музыкальную карьеру как светотехник в составе техперсонала американской трэш-метал-группы Slayer, где он также проверял звук во время концертов. В это время он играл в группе War God с Мишель Меллдрум. В конце этого года его пригласили играть в группу Dark Angel на постоянной основе (и он также стал главным сочинителем лирики на последующих трёх альбомах). Большая слава и известность пришла к нему, когда он записал 2 альбома с группой Death (Individual Thought Patterns в 1993 и Symbolic в 1995), лидер которой, Чак Шульдинер, вёл её во всё более прогрессивный и технически сложный сплав дэт-метала и прогрессивного метала.
Впоследствии, он записал один альбом с трэш-метал-группой Testament и познакомился с канадским мульти-инструменталистом Девином Таунсендом, одним из своих впоследствии самых близких друзей, с которым он записал несколько альбомов, как в составе Strapping Young Lad, так и в сольном проекте Таунсенда. Хоглан также был частью дэт-метал группы лидера Strapping Young Lad, гитариста Джеда Саймона Tenet с 2003 по 2007 года. Они расстались без каких-либо скандалов и неприятностей, и вскоре место Хоглана занял ударник Эдриан Эрландссон.
Следует также отметить, что Джин несколько раз заменял барабащника группы Opeth Мартина Лопеса на концертах (и один раз в клипе) из-за проблем последнего со здоровьем.
Хоглан также играл во многих группах в качестве сессионного музыканта. Он записал альбомы с норвежской блек-метал группой Old Man's Child и датскими дэт-металистами Daemon. Дэт-метал-группа Nile также просила Хоглана записать с ними их альбом In Their Darkened Shrines, но тот ответил отказом, порекомендовав им взамен Тони Лауреано. Спустя некоторое время, Nile, расставшись с Лауреано, снова попытались пригласить Джина, однако и в этот раз (вместе с Дереком Родди) он отклонил предложение, заметив, что Nile «не в его музыкальном вкусе» и познакомил их с греческим барабанщиком Георгом Коллиасом, который и был позже взят в группу. С этих пор Джин и Георг — хорошие друзья и оба очень уважаемые и солидные барабанщики в металлическом сообществе.
Джин работал с Брендоном Смоллом над альбомом вымышленной дэт-метал группы Dethklok, который называется Dethalbum. Джин записал барабаны, в то время как создатель мультфильма Брэндон работал над вокальными, гитарными и басовыми партиями.
Сейчас Хоглан работает с группой Unearth, как временный гастрольный барабанщик, а на постоянной основе играет в проекте Pitch Black Forecast вместе с вокалистом Mushroomhead Джейсоном Попсоном. В 2009 Джин вошёл в обновлённый состав Fear Factory, заменив Раймонд Харрера.
(Джин Хоглан играет на барабанах, иначе отмечено)