Начинал карьеру в «Ренне», с которым вылетел в сезоне 1991/92 в Division 2, где провёл два сезона, а в 1994 году вернулся в элиту. В 1997 году перешёл в «Лаваль» из Division 2, с которым за два сезона не смог завоевать повышения в классе, а в 1999 году присоединился к только что вылетевшему из Division 1 «Лорьяну», что позволило ему в сезоне 2001/02 вновь заиграть в главной лиге Франции. Однако уже в ноябре 2001 года он покинул «мерлуз», чтобы присоединиться к клубу английской премьер-лиги «Ипсвич Таун». За английский клуб Ле Пен провёл на поле лишь 13 минут в одном матче, после чего получил травму. Далее он был отдан в аренду «Страсбуру», а затем окончательно перешёл в этот французский клуб, где играл до конца сезона 2005/06, пока команда не покинула Ligue 1. Следующим его клубом стал вернувшийся в сезоне 2006/07 в элиту «Лорьян». В 2009 году вернулся в клуб Ligue 2 «Лаваль».
Как игрока «Ренна»:
Как игрока «Лорьяна»:
Как игрока «Страсбура»: