Валентин Гомес Фариас родился 14 февраля 1781 года в Гвадалахаре. Отец — коммерсант Хосе Лухардо Гомес де ла Вара, родившийся в Испании, мать — Мария Хосефа Мартинес-и-Фариас.
В 1800 году окончил семинарию в Гвадалахаре, где проникся революционными идеями. Затем изучал медицину в Университете Гвадалахары, который закончил в 1807 году. После окончания университета получил возможность работать учителем в Агуаскальентес. В 1812 году был избран депутатом Кадисских Кортесов, которые приняли Конституцию 1812 года. В 1821 году присоединился к Плану Игуалы, завершению Мексиканской войны за независимость и был депутатом на первом конституционном конгрессе Мексики, провозгласившем императором Агустина I.
4 октября 1817 года женился на Изабель Лопес. У них было шестеро детей, но двое из них умерло в младенческом возрасте.
Политика Гомеса Фариаса во время его президентства в начале 1834 года вызвала такое недовольство консерваторов, что Санта-Анна произвёл государственный переворот, отстранив его от власти, выслав из страны и распустив Конгресс. В 1838 году он вернулся и присоединился к восстанию генерала Хосе де Урреа против Санта-Анны. Восстание потерпело поражение, и Гомес Фариас вынужден был бежать в США. В 1845 году, когда американская армия вторглась на территорию Мексики, он вернулся в Мексику. 6 декабря 1846 года был формально восстановлен мексиканский Конгресс. 24 декабря 1846 Гомес Фариас был назначен вице-президентом при президенте Антонио де Санта-Анна, и, так как Санта-Анна взял на себя командование войсками, он остался выполнять обязанности президента. Снова оказавшись на посту президента, Гомес Фариас убедил реформистов, что война должна быть оплачена средствами, принадлежащими церкви. Это вызвало восстание в Мехико. После этого Санта-Анна, вернувшись с фронта, сместил Гомеса Фариаса с поста президента. Позже, уже в качестве депутата, Гомес Фариас противился заключению мирного договора с США, по которому Мексика потеряла Техас, Калифорнию, Юту и Неваду.
Валентин Гомес Фариас умер 5 июля 1858 года. Католическая церковь отказала в похоронах по церковному обряду, и он был похоронен во дворе дома своей дочери в Микскоаке. В июле 1933 года, его прах был перенесён в Ротонду замечательных персон, в которой покоится прах людей, внесших значительный вклад в историю Мексики.