Родился в белорусо-еврейской семье В Минске. Во время работы в СССР несколько раз был уволен из-за конфликтов с коллегами. Иммигрировал в Канаду из СССР в 1979 году. С 1980 он работал в Университете Конкордия профессором математики.
Стал печально известен тем, что 24 августа 1992 года на рабочем месте расстрелял из револьвера четверых своих коллег, которые, как он утверждает, препятствовали его возведению в штат постоянных профессоров и добивались его увольнения. Он также критиковал приписывание рядом профессоров их соавторства научным работам, в которые они не вносили вклад, в том числе трудам Фабриканта. Это убийство является одним из самых массовых в истории Канады.
Валерий Фабрикант был осуждён на пожизненное заключение без права на помилование до 24 августа 2017 года.