В 1886 году назначен был прозектором при кафедре физиологии животных в Петровско-Разумовской академии.
В 1893 году он защитил диссертацию: «К вопросу об отделении лимфы» (Москва, 1893) на степень доктора медицины и в том же году был назначен старшим лаборантом физиологической лаборатории.
В 1894 г. отправился за границу, где работал у Дюбуа-Раймонда, Касселя и Кенига, и в том же году утвержден экстраординарным профессором физиологии при Юрьевском университете.
Кроме докторской диссертации Попов напечатал: