Родился в 1776 году, единственный сын Московского главнокомандующего генерал-аншефа князя Юрия Владимировича Долгорукова от брака с дочерью генерал-фельдмаршала графа Александра Борисовича Бутурлина Екатериной Александровной.
Получил домашнее образование и в 1789 году был зачислен на военную службу прапорщиком в лейб-гвардии Преображенский полк.
В 1798 году произведён в полковники, а в 1799 году отставлен от службы тем же чином. В 1801 году принят снова на службу с пожалованием в генерал-майоры и определением в Астраханский гренадерский полк. В 1802 году зачислен по армии, 23 июня он был назначен шефом в Черниговский мушкетерский полк; в том же году Высочайшим приказом повелено ему считать старшинство в генеральском чине со 2 марта 1799 года.
В кампанию 1806—1807 годов в Восточной Пруссии князь Долгоруков командовал бригадой, с отличием участвовал в сражениях при Пултуске, Прейсиш-Эйлау, Фридланде и многих других. 8 апреля 1807 года за отличие против французов был награждён орденом св. Георгия 4-й степени (№ 733 по кавалерскому списку Судравского и № 1747 по списку Григоровича—Степанова), а 1 декабря того же года ему была пожалована золотая шпага с алмазными украшениями и надписью «За храбрость».
В 1809 году князь Долгоруков находился в составе вспомогательного русского корпуса, направленного против Австрии, но участия в военных действиях не принимавшего. В том же году, 2 октября, он был назначен назначен шефом Тамбовского мушкетёрского полка и командиром 18-й пехотной дивизии. В 1810 году князь Василий Юрьевич принял участие в турецкой кампании, командуя 18-й пехотной дивизией, причём был во многих сражениях, в том числе при Базарджике, Варне и Шумле. 13 апреля 1810 года он получил орден св. Георгия 3-й степени (№ 204 по кавалерским спискам
Высочайшим приказом 25 сентября 1810 года исключен из списков умершим.
Князь П. В. Долгоруков в своем труде «Сказания о роде князей Долгоруковых» (с. 192—193) характеризует Василия Юрьевича, как «сочетавшего с природным умом доброту душевную». Умер Василий Юрьевич холостым.
Его сестра Варвара была замужем за военным министром генералом от инфантерии князем Алексеем Ивановичем Горчаковым.