Был помощником попечителя Санкт-Петербургского учебного округа. Уже с десятилетнего возраста Кочубей стал собирать монеты, сначала древние, а затем — только греческие и Босфорского царства, и добился того, что его коллекция, по числу и редкости экземпляров (монеты Фарнака, Ольвии, Пантикапеи и пр.), стала лучшим частным минцкабинетом в России. Редчайшие и любопытнейшие монеты своего собрания он сам описал и напечатал для них в Париже 20 таблиц. Эта опись издана вдовой Кочубея: «Описание музеума покойного князя В. П. Кочубея» (составлено по его рукописному каталогу), к которому приложено «Исследование об истории и нумизматике греческих поселений в России, равно как царств Понтийского и Босфора Киммерийского», написанное бароном Кёне (СПб., 1856).