В 1987—1988, в 1990—1991 годах выступал за липецкий «Металлург» во 2-й лиге чемпионата СССР. В общей сложности провел за этот клуб 120 игр и забил 63 гола, что является одним из лучших показателей в истории клуба.
На высшем уровне выступал за московский «Локомотив» и КАМАЗ из Набережных Челнов. Лучший бомбардир чемпионата России 1993 года (21 гол). 26 марта 1994 года в матче с владикавказским «Спартаком» забил пять мячей.
В 1993 году был включён в Список 33 лучших футболистов чемпионата России на втором месте.
В мае 2008 года Панченко был назначен на должность руководителя селекционного отдела московского ЦСКА вместо Владимира Салькова. Ранее Панченко в рамках своей агентской деятельности был причастен к ряду приобретений армейского клуба.
Сын — Кирилл Панченко, нападающий «Мордовии».