В 1908—1909 годы посещает художественную школу Георга Тапперта в Ворпсведе, присущий Тапперту лиризм оказывает влияние на первые работы Вильгельма Моргнера. В 1909 же году художник возвращается в Зост.
В 1911 году переезжает в Берлин, участвует в работе художественной группы Мост (нем. die Br?cke), вместе с которой участвует в берлинской выставке «Нового Сецессиона».
В 1912 году участвует в выставке художников «Зондербунд» в Кёльне, где знакомится с творчеством группы «Синий всадник», оказавшим большое воздействие на дальнейшие работы мастера.
С 1913 года картины В. Моргнера всё более приближаются к абстракционизму. Так, его «Астральные композиции» (1913) крайне лаконичны, крайне скупо изображение горных пейзажей.
Дальнейшее творческое развитие художника было прервано Первой мировой войной. Вильгельм Моргнер в 1914 году призывается на воинскую службу солдатом. От времени его военной службы сохранились лишь небольшие рисунки и эскизы. В августе 1917 года в возрасте 26 лет, художник гибнет на поле сражения.