Виллем ван Мирис родился в семье художников. Его отец, Франц ван Мирис Старший, был известным учеником Г.Доу, старший брат Виллема Ян ван Мирис также был живописцем. После обучения в мастерской отца Виллем в 1683 году Гильдия св. Луки становится членом лейденской гильдии художников. В 1687, 1698, 1704 и 1708 годах он — управляющий делами Гильдии, в 1699 избирается её председателем. В 1694 году ван Мирис, совместно с художниками Якобом Торенфле и Карелом де Моором, основывает в Лейдене Академию искусств Leidse Tekenacademie, просуществовавшую в этом городе до 1736 года. Приблизительно к этому времени художник ван Мирис ослеп и перестал рисовать.
Его сын, Франц ван Мирис Младший также был художником.