Большую часть карьеры Виллиам Араухо играет в качестве арендованного игрока другими клубами. Даже сейчас, когда Араухо выиграл с ЛДУ Кубок Либертадорес и стал финалистом Клубного чемпионата мира, права на футболиста принадлежат скромному клубу Полицейской Академии Кито ЭСПОЛИ из эквадорской Серии А. Он является воспитанником этого клуба, а также «Эль Насьоналя».
В розыгрыше Кубка Либертадорес 2008, в котором ЛДУ впервые в истории эквадорского футбола завоевал международный трофей, стал одним из ключевых игроков команды. Зачастую усиливал в победном турнире игру с выходом на замену (из 12 проведённых матчей в 8 он выходил на замену).