Энгонга, родившийся в Барселоне, детство провёл в Кантабрии, там же и начинал играть в футбол. Первым взрослым клубом Висенте была «Гимнастика» из Торрелавеги, после Энгонга играл за «Спортинг Маонес».
В 1991 году Энгонга перешёл в клуб Примеры «Реал Валльядолид», однако в первом же сезоне эта команда покинула элитный дивизион. Полузащитник перебрался в «Сельту», где провёл 2 сезона и сыграл 72 матча, после чего оказался в «Валенсии». Игроком основы «летучих мышей» Висенте стал только в сезоне 1996—1997, сыграв в 35 матчах.
После первого полного сезона за «Валенсию» Энгонга перешёл в сильную «Мальорку» Эктора Купера, с которой Висенте выиграл единственный в своей карьере крупный трофей — Суперкубок Испании. Дважды «Мальорка» поднималась на третью строчку в турнирной таблице. Команда показывала хорошие результаты вплоть до сезона 2001—2002. 36-летний Энгонга сыграл только в 20 его матчах, а «Мальорка» была близка к вылету из Примеры.
В 2002 году Энгонга перешёл в клуб Сегунды «Овьедо», где играл на протяжении 6 месяцев, после чего отправился в аренду в английский «Ковентри Сити», где и завершил карьеру.
Энгонга дебютировал в сборной Испании 23 сентября 1998 года в матче с командой России (4:1). Вместе с ней он выступал на чемпионате Европы 2000 года, где сыграл в 1 матче.
С 2008 по 2009 год Энгонга тренировал сборную Экваториальной Гвинеи.