В 1958 окончил Московский государственный университет; в 1974 году получил степень доктора биологических наук, а в 1982 — звание профессора; член-корреспондент АН СССР с 1979, академик АН СССР c 1990; в период 1958—1985 был поочерёдно старшим лаборантом, младшим научным сотрудником, заведующим лабораторией, заместителем директора по научной работе; с 1985 года — директор Института цитологии и генетики СО АН СССР/РАН; с 2008 года — советник РАН
Владимир Константинович Шумный — автор более 350 научных работ, в том числе четырех монографий и двух учебников, по проблемам генетики;
Женат, имеет двоих детей: Тараса и Люду.