26 июля 2008 года менеджер велокоманды Астана Йохан Брюнель в сообщил об отчислении из состава Владимира Гусева из-за „ненормальных“ уровней биохимических показателей в пробе крови во взятой в рамках внутрикомандных допинг-тестов:
Подозрительные допинг-пробы были переданы в WADA. 5 августа того же года Федерация велосипедного спорта России по настоянию министра спорта Виталия Мутко исключила Гусева из состава Олимпийской сборной России для участия в пекинской Олимпиаде во избежание возможных допинговых скандалов.
В конце октября 2008 года Владимир Гусев подал иск в Арбитражный спортивный суд в Лозанне в отношении команды Астана и выиграл дело 18 июня 2009 года. Суд обязал казахстанскую команду выплатить всю сумму по контракту и компенсацию за моральный ущерб российскому велогонщику.