Ученик Ивана Гржимали, первоначально стал в 1882 году по рекомендации своего младшего брата учителем музыки у детей Надежды фон Мекк, участвовал в её домашних концертах. В дальнейшем начал выполнять обязанности личного секретаря фон Мекк, а затем вступил в брак с её дочерью Юлией (1853—1915). Пахульский-старший служил в ряде случаев посредником между фон Мекк и Петром Ильичом Чайковским, которому она покровительствовала.
В биографической киноленте «Чайковский» роль Пахульского исполнил Кирилл Лавров.