В 1892 году после окончания обучения в Высшей Духовной семинарии в Пшемысле был рукоположён в священника. Служил викарием в приходе города Польна, где проработал в течение пятнадцати месяцев, после чего продолжил теологическое обучение в Папском Григорианском Университете. После возвращения в Польшу преподавал догматику в семинарии города Пшемысля, исполнял обязанности префекта, ректора. В 1928 году заболел тяжёлой болезнью и оставил исполнение обязанностей ректора семинарии. Получил известность среди верующих как духовник и исповедник. Умер 15 марта 1948 года в Пшемысле.
18.08.2002 года Ян Балицкий был причислен к лику блаженных римским папой Иоанном Павлом II.
День памяти — 15 марта.