Родился и вырос в Утрехте. Учился у Абрахама Блумарта. Покинул родную Голландию в двадцать лет, путешествовал по Франции и Италии, долгое время жил в Риме.
Его картины представляют собой композиции с изображением романтизированного преимущественно итальянского пейзажа, иногда с фигурами крестьян, пастухов, путников. Отличительной чертой является золотистый колорит - можно сказать, что с творчеством Яна Бота в голландскую пейзажную живопись вошел солнечный свет. Оказал влияние на Яна Баптиста Веникса и Альберта Кейпа, которые вслед за ним также стали "певцами солнечного света".
Сотрудничал с братом Андрисом Ботом, Корнелиусом ван Пуленбургом и Николаусом Кнюпфером.