Известная чехословацкая (в дальнейшем чешская) теннисистка. В 2006 году приняла также американское гражданство.Одна из самых ярких звезд женского тенниса 90-х годов.
За карьеру выиграла 24 одиночных турнира и 76 парных соревнований. Профессиональная теннисистка в 1987-99 годах.
Наивысшая позиция в рейтинге – 2 (28 сентября 1997 года).
Наиболее удачно спортсменка выступала на быстрых покрытиях (в частности, на кортах Уимблдона). Одна из немногих игроков, делавших акцент на игре с лета. Это очень эффектный, но сложный с технической точки зрения элемент тенниса.
Первоначально Новотна громко заявила о себе как парный игрок. Но благодаря тренеру Хане Мандликовой в дальнейшем Яна стала отличным игроком в одиночных соревнованиях. В четвертьфинале Открытого чемпионата Австралии 1991 года Новотна сенсационно обыгрывает первую ракетку мира Штеффи Граф,в полуфинале переигрывает третью в рейтинге сильнейших Аранчу Санчес-Викарио.В финале в напряженном матче уступает второй ракетке мира Монике Селеш. С этого момента начинается восхождение чешки на теннисный Олимп. В 1993 и 1997 годах играет в финалах Уимблдона. Особенно драматично складывался финал 1993 года, где Новотна встречалась с Граф. В третьем сете чешка вела со счетом 4:1, но упустила победу. Пять геймов подряд выигрывает легендарная немка и в пятый раз поднимает кубок Уимблдона. Новотна плачет на церемонии награждения и заверяет болельщиков, что все равно победит на Уимблдоне. В 1998 году приходит долгожданная победа. В финале Новотна обыгрывает француженку Натали Тозья. Это единственная победа спортсменки в одиночных соревнованиях турниров Большого Шлема.
Наивысшими позициями в рейтинге отмечены сезоны 1997-98 годов,когда Новотна входила в тройку сильнейших и боролась за звание первой ракетки мира.
В 1998 году она могла бы стать первой ракеткой мира в случае победы на Открытом чемпионате США, но оступилась в полуфинале соревнования. В 1999 году завершает выступления в профессиональном Туре.
За карьеру заработала 11,2 млн. долларов.
Очень успешно Новотна выступала в парных соревнованиях. В 1988 году в Сеуле становится серебряным призёром Олимпиады в паре с Хеленой Суковой. В 1996 году в Атланте повторно с Х. Суковой завоевала серебряную медаль. Также выиграла бронзовую медаль в одиночном турнире на Олимпиаде в Атланте. 12 раз выигрывала турниры Большого Шлема в паре.