С 1993 по 2005 выступал в составе финской пауэр-метал группы Stratovarius. По слухам он покинул группу оттого, что устал работать вместе со своим бывшим начальником Тимо Толкки. Яри исполнил партии бас-гитары на альбоме Stratovarius 2005 года, но после этого покинул группу. Его место занял Лаури Порра.
Два года Яри играл в собственной группе «Mess», после чего вошел в состав шведской прогрессив-метал-группы «Evergrey».
Покинув «Evergrey», в 2010 году Яри присоединился к новой группе Тимо Толкки «Symfonia».
Яри Кайнулайнен играет на шестиструнной бас-гитаре фирмы «Ibanez», а также использует оборудование фирмы «Ampeg».