Родился в семье ремесленника. Закончил Киевский университет им. Т. Г. Шевченко. (1954). Участник Великой Отечественной войны. Работал на Киевской киностудии научно-популярных фильмов «Киевнаучфильм» с 1952 по 1979 годы. Главный редактор студии (1961—1979).
Автор научно -фантастической повести «Прыжок в бессмертие» (издательство «Молодь» 1960), сборников статей о научном кино «Фильмы, образы, формулы» (K.,1971), «От мысли к образу» (К., 1986), «Эффект Кассандры» (K., 1984), многочисленных статей в сборниках и периодической прессе, юмористических рассказов опубликованных в «Литературной газете». По сценариям Евгения Загданского поставлено более тридцати научно-популярных и анимационных фильмов.
Награждён орденом Красной Звезды, орденом Трудового красного знамени, Почетной грамотой Президиума Верховного Совета Украины, значком «Отличник кинематографии СССР». Был членом Союза кинематографистов СССР.
Супруга: Загданская Лия Исааковна (1919—1988), дочь Загданская, Нина Евгеньевна (1947 г. рожд.) сын Загданский, Андрей Евгеньевич (1956 г. рожд.)
В 2010 Андрей Загданский сделал документальный фильм "Мой отец Евгений".