В 1274 году умер отец Жанны Генрих I (король Наварры). Кроме Жанны, у короля не осталось законных детей, а поскольку к этому времени в живых уже не было никого из прямых потомков по мужской линии шампанской династии, правившей Наваррой с 1234, Жанна была провозглашена графиней Шампани и королевой Наварры. Регентом страны при малолетней королеве стала её мать Бланка д’Артуа. Новой королеве и её матери пришлось защищать своё имущество от посягательств различных иностранных держав, которые могли легко захватить богатые владения в Шампани и Наварре. Это вынудило Бланку обратиться за поддержкой к французскому королю Филиппу III. 6 августа 1284 тринадцатилетняя Жанна вышла замуж за наследника французской короны Филиппа, который через год стал королём Филиппом IV.Это брак дал возможность присоединить к королевскому домену Шампань, а также привёл к первому объединению Франции и Наварры в рамках личной унии (до 1328 года). С 1285 года королева Франции. В 1304 году основала в Париже Наваррскую коллегию. Она направила армию против графа де Бар, который поднял восстание против неё, как графини Шампани.
Жанна Наваррская умерла при загадочных обстоятельствах на 35-м году жизни 4 апреля 1305 во время родов, и некоторые летописцы считали, виновным в её смерти Филиппа IV. Трое выживших сыновей последовательно занимали престол Франции, а единственная выжившая дочь стала королевой Англии. После её смерти в 1305 году в Наварре ей наследовал старший сын Людовик, будущий Людовик X, король Франции. А Шампань оказалась присоединена к домену короля Франции.
Была замужем с 16 августа 1284 за Филиппом IV (1268—29 ноября 1314), королем Франции. Это брак дал возможность присоединить к королевскому домену Шампань, а также привёл к первому объединению Франции и Наварры в рамках личной унии (до 1328 года).
В этом браке родились: