Жанна унаследовала графство Бургундия в девятилетнем возрасте после смерти отца. Регентшей при Жанне была её мать, Маргарита де Блуа, дочь графа Тибо V де Блуа, вышедшая после смерти Оттона I замуж за Готье II д'Авен, графа де Гиз. Жанна умерла в 1205 году так и не достигнув совершеннолетия, после чего графство унаследовала её младшая сестра Беатрис.