Установлена линия приращения перикарда к крупным сосудистым стволам у человека, которая, максимально смещена к периферии, что обусловливает наибольшую свободу движения сердца. Выявлены пути преобразования венозного синуса и синусных клапанов правого предсердия в процессе эволюции. Описаны особенности рецессуса левого предсердия, и расположения устьев лёгочных вен, а также значительное изменение в расположении атриовентрикулярных и артериальных отверстий. Установлено веретенообразное расширение восходящей аорты с последующим завершением резким перешейком после отхождения трёх крупных стволов. Дана детальная характеристика овального окна и евстахиева клапана при нём; наличие весьма большого отверстия, короткий клапан без нитей на конце предрасполагают к сохранению сквозного хода и развитию ряда других врождённых дефектов. Кроме сердца, большое место в сравнительно-анатомических исследованиях В. Н. Жеденова занимали лёгкие животных и человека. Сравнительная анатомия лёгких рассматривалась в аспекте их общих морфофункциональных особенностей, возникновения и поступательного преобразования в филогенезе, долевого расчленения бронхососудистых ветвлений, формирования на этапах онтогенеза и др.
Полученные данные интерпретированы с позиций эволюционной морфологии на основе учения А. Н. Северцова, который следил за ходом его ранних исследований. В. Н. Жеденов тесно сотрудничал с Институтом эволюционной морфологии АН СССР, его работы по представлению академиков Л. А. Орбели и И. И. Шмальгаузена опубликованы в «Докладах АН СССР». Результаты исследований обобщены в монографии «Лёгкие и сердце животных и человека» (1954, 1961). Наряду с высоким теоретическим значением труды учёного нашли практическое применение в отечественной кардиохирургии, особенно при врождённых пороках сердца. Ими пользовались А. Н. Бакулев и его ученики. В. Н. Жеденов создал школу сравнительных анатомов. Научную и педагогическую деятельность он успешно сочетал с организационно-общественной. Награждён орденом Трудового Красного Знамени и медалями.