В 1891 окончил с золотой медалью 2-ю московскую гимназию. В 1892 поступил на медицинский факультет Варшавского университета, после третьего курса не закончив его, поступил в на аграрное отделение Ново-Александрийского института сельского хозяйства и лесоводства, который окончил в 1898 году получив звание ученого агронома 1-го разряда..
В 1898—1908 гг. занимался вопросами еврейской колонизацией в западных губерниях Российской империи, опубликовал ряд работ о еврейской колонизации и экономической жизни в которых описал историю еврейской земледельческой колонизации. Сотрудничает с Обществом развития земледелия и ремесел среди евреев.
В 1904—1905 гг. — представлял евреев в Союзе освобождения в работе которого принимал участие с момента создания вместе с Ароном Соломоновичем Ланде (он же Александр Соломонович Изгоев), Екатериной Дмитриевной Кусковой, Сергеем Николаевичем Прокоповичем, Павлом Николаевичем Милюковым, Петром Бернгардовичем Струве.
С 1908 преподавал в Петербургском сельско-хозяйственном институте. Автор ряда работ по сельскому-хозяйству, а отчасти и общей экономике, а также статистико-экономических работ о еврейском населении России.
В 1913 г. участвует в создании Агрономического журнала совместно с В. Анисимовым. Н. Огановским, Н. Катаевым, А. Кулыжным, П. Масловым, А. Фортунатовым, А. Чаяновым, А. Челинцевым и другими агрономами-экономистами и кооператорами.
По постановлению Петроградского губотдела ГПУ от 29 октября 1922 года выслан за границу.
В 1923—1932 годах читал лекции по сельскому хозяйству и политической экономии в Русском научном институте в Берлине и преподавал в Идишском университете в Вильнюсе.
С 1930 года, вместе с И. А. Ильиным, участвовал в ряде анти-большевистских мероприятий в Германии.
В 1932 году переехал в Париж
В апреле 1935 эмигрировал в Палестину, где читал лекции на кафедре сельскохозяйственной экономики и политики в Еврейском университете в Иерусалиме.
Бруцкус был сторонником либеральной экономики и свободного рынка, был одним из ведущих критиков плановой экономики.
По словам сына Б. Д. Бруцкуса — Леонида (Элиезера), написавшего его биографию на английском языке, Б. Д. Бруцкус принадлежал к «мозговому тресту российской аграрной политики и поддерживал реформы П.А.Столыпина, направленные на ликвидацию сельской общины и на создание крепкого фермерства, производящего товарную продукцию и способного создать накопления для дальнейшего индустриального роста страны.
На его взгляды оказали влияние народнические идеи, „еврейские национальные идеи“, протест в связи с гонениями на евреев в Москве (1891—92). Участвовал в общественных дискуссиях народников и марксистов.
В 1902 г. женился на Эмилии Осиповне Зайденман (1873—1952). У них родились трое сыновей: